冷凍式干燥機應安裝在環境溫度為2-45℃，四周通風良好，空氣潔凈的建筑物內；特別是避免空氣中含有腐蝕類成份（如氨）。當室內機房通風條件不良時，需在機房內安裝換氣排風設備。
冷干機與空壓機之間至少有4-5米的距離，以防止空壓機產生的振動影響冷干機正常運行。
風冷型冷干機的進風口與墻體距離1.5m以上，兩臺干燥機的進風口與排風口不能面對面。冷干機四周應留有一定的空間，以方便維修和日常維護。
與水冷式超低溫真空冷凍干燥機相比，風冷式超低溫真空冷凍干燥機對環境要求較高，但安裝方便、使用簡單。凍干機起源于19世紀20年代的真空冷凍干燥技術經歷了幾十年的起伏和徘徊后，在的20年中取得了長足進展。但是也有一部分水霧在經過過濾器時被集中和除去。冷凍干燥機過濾器的主要作用是過濾壓縮空氣中的固體顆粒。
從空壓機出來的熱而潮濕并含有水份的壓縮空氣首先經過空氣對空氣熱交換器預冷卻;然后經過預冷卻的空氣，在空氣對冷媒熱交換器被冷干機的冷凍劑循環回路進一步冷卻，水冷式超低溫真空冷凍干燥機對環境溫度不敏感，不過它對冷卻水的要求更高，但水冷式的安裝較風冷式復雜；進入21世紀，真空凍干技術憑借其它干燥方法無法比擬的優點，越來越受到人們的青睞，除了在、生物制品、食品、血液制品、活性物質領域得到廣泛應用。
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